Hugo_Symbol FAKE_P001_S2 FAKE_P001_S3 FAKE_P001_S4 FAKE_P001_S5 FAKE_P001_S6 FAKE_P001_S7 ABL1 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 ACVR1 3;1 3;1 3;1 3;1 3;1 2;1 AGO2 3;1 3;1 2;1 3;1 3;1 2;1 AKT1 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 AKT2 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 AKT3 0;0 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 ALK 3;1 3;1 1;0 3;1 2;0 2;1 ALOX12B 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 AMER1 2;0 1;0 1;0 2;0 2;0 2;0 ANKRD11 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 APC 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 AR 2;0 1;0 1;0 2;0 2;0 2;0 ARAF 2;0 1;0 1;0 2;0 2;0 2;0 ARID1A 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 ARID1B 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 ARID2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 ARID5B 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 ASXL1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 ASXL2 3;1 3;1 1;0 3;1 3;1 2;1 ATM 2;1 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 ATR 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 ATRX 2;0 1;0 1;0 1;0 2;0 1;0 AURKA 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 AURKB 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 AXIN1 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 AXIN2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 AXL 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 B2M 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 BABAM1 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 BAP1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 BARD1 3;1 3;1 3;1 3;1 3;1 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2;1 2;1 2;1 KRAS 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 LATS1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 LATS2 2;1 1;0 2;1 1;0 0;0 2;1 LMO1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 LYN 3;1 3;1 2;1 3;1 3;1 2;1 MALT1 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 MAP2K1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MAP2K2 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 MAP2K4 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MAP3K1 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 MAP3K13 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MAP3K14 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MAPK1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MAPK3 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 MAPKAP1 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 MAX 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 MCL1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MDC1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MDM2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MDM4 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MED12 2;0 1;0 1;0 2;0 2;0 2;0 MEF2B 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 MEN1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MET 0;0 3;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MGA 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MITF 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MLH1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MPL 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MRE11A 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 MSH2 3;0 3;0 1;0 3;0 2;0 2;1 MSH3 2;1 2;1 3;1 2;1 1;0 2;1 MSH6 3;0 3;0 1;0 3;0 2;0 2;1 MSI1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MSI2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MST1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MST1R 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MTOR 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MUTYH 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MYC 3;1 3;1 2;1 3;1 3;1 2;1 MYCL 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MYCN 3;1 3;1 3;NA 3;1 3;1 2;1 MYD88 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 MYOD1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NBN 3;1 3;1 2;1 3;1 3;1 2;1 NCOA3 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NCOR1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NEGR1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NF1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NF2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NFE2L2 3;1 3;1 3;1 3;1 3;1 2;1 NFKBIA 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 NKX2-1 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 NKX3-1 3;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 NOTCH1 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 NOTCH2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NOTCH3 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 NOTCH4 2;1 2;1 0;0 2;1 2;1 2;1 NPM1 2;1 2;1 1;0 2;1 2;1 2;1 NRAS 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NSD1 2;1 2;1 1;0 2;1 2;1 2;1 NTHL1 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 NTRK1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NTRK2 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 NTRK3 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NUF2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 NUP93 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PAK1 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 PAK5 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PALB2 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 PARK2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PARP1 0;0 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 PAX5 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 PBRM1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PDCD1 3;1 3;1 3;1 3;1 3;1 2;1 PDCD1LG2 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 PDGFRA 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PDGFRB 2;1 2;1 1;0 2;1 2;1 2;1 PDPK1 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 PGR 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 PHOX2B 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PIK3C2G 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PIK3C3 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 PIK3CA 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PIK3CB 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PIK3CD 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PIK3CG 0;0 3;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PIK3R1 1;0 1;0 3;1 1;0 1;0 2;1 PIK3R2 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 PIK3R3 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PIM1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PLCG2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PLK2 2;1 2;1 3;1 2;1 1;0 2;1 PMAIP1 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 PMS1 3;1 3;1 3;1 3;1 3;1 2;1 PMS2 0;0 1;0 0;0 1;0 2;1 0;0 PNRC1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 POLD1 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 POLE 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PPARG 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PPM1D 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PPP2R1A 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 PPP4R2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PPP6C 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 PRDM1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PRDM14 3;1 3;1 2;1 3;1 3;1 2;1 PREX2 3;1 3;1 2;1 3;1 3;1 2;1 PRKAR1A 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PRKCI 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PRKD1 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 PTCH1 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 PTEN 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 PTP4A1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PTPN11 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 PTPRD 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 PTPRS 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 PTPRT 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RAB35 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RAC1 0;0 1;0 0;0 1;0 2;1 0;0 RAC2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RAD21 3;1 3;1 2;1 3;1 3;1 2;1 RAD50 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 RAD51 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RAD51B 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 RAD51C 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RAD51D 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RAD52 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RAD54L 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RAF1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RARA 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RASA1 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 RB1 2;1 1;0 2;1 1;0 0;0 2;1 RBM10 2;0 1;0 1;0 2;0 2;0 2;0 RECQL 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RECQL4 3;1 3;1 2;1 1;0 3;1 2;1 REL 3;0 3;0 3;1 3;0 2;0 2;1 RET 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 RFWD2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RHEB 4;2 3;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RHOA 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RICTOR 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 RIT1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RNF43 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 ROS1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RPS6KA4 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RPS6KB2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RPTOR 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RRAGC 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RRAS 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 RRAS2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RTEL1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RUNX1 0;0 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 RXRA 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 RYBP 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SDHA 2;1 2;1 0;0 2;1 2;1 2;1 SDHAF2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SDHB 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SDHC 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SDHD 2;1 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 SESN1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SESN2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SESN3 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 SETD2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SF3B1 3;1 3;1 3;1 3;1 3;1 2;1 SH2B3 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SH2D1A 2;0 1;0 1;0 1;0 2;0 1;0 SHOC2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 SHQ1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SLX4 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 SMAD2 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 SMAD3 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SMAD4 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 SMARCA4 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 SMARCB1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SMARCD1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SMO 0;0 3;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SMYD3 0;0 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 SOCS1 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 SOS1 3;0 3;0 1;0 3;0 2;0 2;1 SOX17 3;1 3;1 2;1 3;1 3;1 2;1 SOX2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SOX9 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SPEN 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SPOP 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SPRED1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SRC 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SRSF2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 STAG2 2;0 1;0 1;0 1;0 2;0 1;0 STAT3 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 STAT5A 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 STAT5B 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 STK11 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 STK19 2;1 2;1 0;0 2;1 2;1 2;1 STK40 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SUFU 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 SUZ12 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 SYK 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 TAP1 2;1 2;1 0;0 2;1 2;1 2;1 TAP2 2;1 2;1 0;0 2;1 2;1 2;1 TBX3 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 TCEB1 3;1 3;1 2;1 3;1 3;1 2;1 TCF3 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 TCF7L2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 TEK 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 TERT 2;1 2;1 0;0 2;1 2;1 2;1 TET1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 TET2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 TGFBR1 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 TGFBR2 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 TMEM127 3;1 3;1 3;1 3;1 3;1 2;1 TMPRSS2 0;0 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 TNFAIP3 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 TNFRSF14 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 TOP1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 TP53 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 TP53BP1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 TP63 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 TRAF2 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 TRAF7 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 TSC1 1;0 1;0 0;0 1;0 1;0 2;1 TSC2 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 TSHR 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 U2AF1 0;0 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 UPF1 2;1 2;1 0;0 2;1 0;0 2;1 VEGFA 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 VHL 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 0;0 VTCN1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 WHSC1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 WHSC1L1 3;1 2;1 1;0 2;1 2;1 2;1 WT1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 WWTR1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 XIAP 2;0 1;0 1;0 1;0 2;0 1;0 XPO1 3;0 3;0 3;1 3;0 2;0 2;1 XRCC2 4;2 3;1 2;1 2;1 2;1 2;1 YAP1 1;0 1;0 2;1 1;0 1;0 2;1 YES1 2;1 2;1 3;1 2;1 2;1 2;1 ZFHX3 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 2;1 ZRSR2 2;0 1;0 1;0 1;0 2;0 2;0