##fileformat=VCFv4.2
##ALT=<ID=DEL,Description="Deletion">
##ALT=<ID=INS,Description="Insertion">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=VIPC_S,Number=.,Type=String,Description="VIP decision tree classification.">
##INFO=<ID=BND_DEPTH,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth at local translocation breakend">
##INFO=<ID=MATEID,Number=.,Type=String,Description="ID of mate breakend">
##INFO=<ID=MATE_BND_DEPTH,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth at remote translocation mate breakend">
##INFO=<ID=ReverseComplementedAlleles,Number=0,Type=Flag,Description="The REF and the ALT alleles have been reverse complemented in liftover since the mapping from the previous reference to the current one was on the negative strand.">
##INFO=<ID=SVLEN,Number=.,Type=Integer,Description="Difference in length between REF and ALT alleles">
##INFO=<ID=SVTYPE,Number=1,Type=String,Description="Type of structural variant">
##INFO=<ID=SwappedAlleles,Number=0,Type=Flag,Description="The REF and the ALT alleles have been swapped in liftover due to changes in the reference. It is possible that not all INFO annotations reflect this swap, and in the genotypes, only the GT, PL, and AD fields have been modified. You should check the TAGS_TO_REVERSE parameter that was used during the LiftOver to be sure.">
##contig=<ID=chr1,length=248956422>
##contig=<ID=chr2,length=242193529>
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chr1	152548312	symbolic1	A	<DEL>	.	PASS	SVLEN=-49314;SVTYPE=DEL	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr2	47408528	symbolic2	G	<INS>	.	PASS	SVLEN=-49314;SVTYPE=INS	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr4	105399137	.	G	A	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr7	41977712	single_breakend_nation	C	C.	.	PASS	SVTYPE=BND	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr7	42025358	.	GACTC	G	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
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chr8	144085597	.	CAG	C	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr9	104784352	.	AAAGAT	A	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr10	124402930	.	G	C	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr11	134144330	breakend2	G	G[8:61765143[	.	PASS	BND_DEPTH=39;MATEID=breakend1;MATE_BND_DEPTH=26;SVTYPE=BND	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr13	76995993	.	G	A	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr14	88870063	.	TG	T	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr14	104701523	.	T	G	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr17	31229046	.	AC	A	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr17	31336861	.	T	G	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr19	11105470	.	C	G	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
chr19	17341188	.	GA	G	.	PASS	.	GT:DP:VIPC_S	0|0:10	0|0:50	0|0:50	1|0:50:U1	0|0:50	0|0:50
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